Achievements

原著論文・総説

  1. Hilda Mardiana Pratiwi, Masahiro Hirasawa, Kohki Kato, Keijiro Munakata, Shogo Ueda, Yuuta Moriyama, Reiko Yu, Toru Kawanishi, and Mikiko Tanaka(2023). Heterochronic development of pelvic fins in zebrafish: possible involvement of temporal regulation of pitx1 expression. Front Cell Dev Biol 2023; 11: 1170691. DOI: https://doi.org/10.3389/fcell.2023.1170691

  2. Satomi F Ono, Ingrid Rosenburg Cordeiro , Osamu Kishida, Haruki Ochi and Mikiko Tanaka(2023). Air-breathing behavior underlies the cell death in limbs of Rana pirica tadpoles. Zoological Letters 9, 2. DOI: https://doi.org/10.1186/s40851-022-00199-x

  3. Ingrid Rosenburg Cordeiro, Reiko Yu and Mikiko Tanaka (2020). Regulation of the limb shape during the development of the Chinese softshell turtles. Evol. Dev. 2020, e12352.

  4. Ingrid Rosenburg Cordeiro, and Mikiko Tanaka (2020). Environmental Oxygen is a Key Modulator of Development and Evolution: From Molecules to Ecology. BioEssays 42, 202000025. DOI: https://doi.org/10.1002/bies.202000025

  5. Ingrid Rosenburg Cordeiro, Kaori Kabashima, Haruki Ochi, Keijiro Munakata, Chika Nishimori, Mara Laslo, James Hanken, and Mikiko Tanaka (2019). Environmental oxygen exposure allows for the evolution of interdigital cell death in limb patterning. Developmental Cell 50, 155-166. DOI: https://doi.org/10.1016/j.devcel.2019.05.025

  6. Kenta Kawahata*, Ingrid Rosenburg Cordeiro*, Shogo Ueda, Guojun Sheng, Yuuta Moriyama, Chika Nishimori, Reiko Yu,

Makoto Koizumi, Masataka Okabe, and Mikiko Tanaka (2019). Evolution of the avian digital pattern. Scientific Reports 9, article number 8560. (*These authors contributed equally to this work)

  1. Yuuta Moriyama, Hilda Mardiana Pratiwi, Shogo Ueda, Mikiko Tanaka (2019).

Localization of β-catenin and Islet in the pelvic fin field in zebrafih. Zoological Science 36, 365-371.

  1. Mikiko Tanaka (2019). Preface- Ecology, Evolution and Development.

Development, Growth & Differentiation Special Issue “Ecology, Evolution and Development” 61, 3-4. (invited)

  1. Eri Okamoto*, Yuuta Moriyama*, Shigehiro Kuraku, Kei-ichi Kai, Mikiko Tanaka (2019).

Involvement of HGF/MET signaling in appendicular muscle development in cartilaginous fish. Development, Growth & Differentiation Special Issue “Ecology, Evolution and Development” (*These authors contributed equally to this work) (invited) 61, 97-103.

  1. Shogo Ueda, Ingrid Rosenburg Cordeiro, Yuuta Moriyama, Chika Nishiomri, Kei-ichi Kai,

Reiko Yu, Ryuichiro Nakato, Katsuhiko Shirahige, and Mikiko Tanaka (2019). Cux2 refines the forelimb field by controlling expression of Raldh2 and Hox genes. Biology Open 8, bio040584.

  1. Eri Okamoto, Mai Van Hieu, Atsushi Ishimatsu, Mikiko Tanaka (2018). Modification of pectoral fins occurred during the larval-juvenile

transition in the mudskipper (Periophthalmus modestus). Zoological Letters 4, 23. doi: 10.1186/s40851-018-0105-z.

  1. Mikiko Tanaka (2018).

Alterations in anterior-posterior patterning and its accompanying changes along the proximal-distal axis during the fin-to-limb transition. Genesis 56, e23053. (Invited)

  1. Eri Okamoto, Rie kusakabe, Shigehiro Kuraku, Susumu Hyodo, Alexandre Robert-Moreno, Koh Onimaru, James Sharpe, Shigeru Kuratani,

Mikiko Tanaka (2017). Migratory appendicular muscles precursor cells in the common ancestor to all vertebrates Nature Ecology & Evolution 1, 1731-1736. DOI: 10.1038/s41559-017-0330-4.

  1. Mikiko Tanaka (2017). Evolution of vertebrate limb development (version 2). Essential for Life Sciences doi: 10.1002/9780470015902.a0002099.pub2. (Invited)

  2. Shogo Ueda, Takayuki Suzuki and Mikiko Tanaka (2017).

Transgene introduction into the chick limb bud by electroporation. Methods in Molecular Biology: Avian and reptilian Developmental Biology. 1650, 203-208. doi: 10.1007/978-1-4939-7216-6_13. (Invited)

  1. Kanami Noguchi, Ryota Ishikawa, Kanako Miyoshi, Masahumi Kawaguchi, Takahiko Kawasaki, Tatsumi Hirata, Makiko Fukui, Shigeru Kuratani, Mikiko Tanaka and Yasunori Murakami (2017).

Expression patterns of Sema3A in developing amniote limbs: with reference to the diversification of peripheral nerve innervation. Dev. Growth Differ. 59, 270-285. doi: 10.1111/dgd.12364.

  1. Koh Onimaru, Luciano Marcon, Marco Musy, Mikiko Tanaka, James Sharpe (2016).

The fin to limb transition as the re-organisation of a Turing pattern. Nature Communications 7, Article number 11582

  1. Mikiko Tanaka (2016).

Developmental mechanism of limb field specification along the anterior-posterior axis during vertebrate evolution. J. Dev. Biol. 4, 18. (Invited)

  1. Mikiko Tanaka (2016).

Fins into limbs: autopod acquisition and anterior elements reduction by modifying gene networks involving 5’Hox, Gli3 and Shh. Dev. Biol. 413, 1-7

  1. Shinji Masuda and Mikiko Tanaka (2016).

PICCORO:A technique for manipulating the activity of transcription factors with blue light. Methods in Cell Biology: The Zebrafish, 4th edition, Volume 3-Genetics, Genomics, and Transcriptomics. 135, 289-295. doi: 10.1016/bs.mcb.2016.03.009. (Invited)

  1. Koh Onimaru, Shigehiro Kuraku, Wataru Takagi, Susumu Hyodo, James Sharpe and Mikiko Tanaka (2015).

A shift in anterior-posterior positional information underlies the fin-to-limb evolution. eLife DOI: http://dx.doi.org/10.7554/eLife.07048

  1. Mikiko Tanaka, Reiko Yu, Daisuke Kurokawa (2015).

Anterior migration of lateral plate mesodermal cells during embryogenesis of the pufferfish Takifugu niphobles: Insight into the rostral positioning of pelvic fins. J. Anat. 227, 81-88.

  1. Hiroki Kaneko, Yuki Nakatani, Koji Fujimura and Mikiko Tanaka (2014).

Development of the lateral plate mesoderm in medaka Oryzias latipes and Nile tilapia Oreochromis niloticus: insight into the diversification of pelvic fin position. J. Anat. 225, 659-674.

  1. Natsuno Suda, Takehiko Itoh, Ryuichiro Nakato, Daisuke Shirakawa, Masashige Bando, Yuki Katou,

Kohsuke Kataoka, Katsuhiko Shirahige, Cheryll Tickle and Mikiko Tanaka (2014). Dimeric combinations of MafB, cFos and cJun control the apoptosis-survival balance in limb morphogenesis. Development 141, 2885-2894. [PubMed] This paper is recommended by Faculty of 1000.

  1. Shinji Masuda, Yuki Nakatani, Shukun Ren, Mikiko Tanaka (2013).

Blue light-mediated manipulation of transcription factor activity in vivo. ACS Chem. Biol. 8, 2649-2653. [PubMed]

  1. Mikiko Tanaka (2013). Molecular and evolutionary basis of limb

field specification and limb initiation. Dev. Growth Differ. 55, 149-163. (Invited) [PubMed]

  1. Mikiko Tanaka and Koh Onimaru (2012). Acquisition of the paired fins : a view from the sequential evolution of the lateral plate mesoderm.

Evol. Dev. 14,412-420 [PubMed]

  1. Yohichiro Hosokawa*, Haruki Ochi, Takanori Iino, Akihiro Hiraoka and Mikiko

Tanaka* (2011). Photoporation of biomolecules into single cells in living vertebrate embryos induced by a femtosecond laser amplifier. PLoS One 6, e27677.(*Co-corresponding authors. These authors contributed equally to this work.) [PubMed]

  1. Koh Onimaru*, Eiichi Shoguchi, Shigeru Kuratani and Mikiko Tanaka* (2011). Development and evolution of the lateral plate mesoderm: Comparative analysis of amphioxus and lamprey with implications for the acquisition of paired fins. Dev. Biol. 359, 124-136.(*Co-corresponding authors.)

[PubMed]

  1. Yasunori Murakami* and Mikiko Tanaka* (2011).Evolution of Motor innervation to fins and limbs.

Dev. Biol. 355, 164-172. (*Co-corresponding authors.) [PubMed]

  1. Mikiko Tanaka (2011). Revealing the mechanisms of rostral shift of

pelvic fins among teleost fishes. Evol. Dev. 13, 380-388. [PubMed]

  1. Yumie Murata*, Mika Tamura*, Yusuke Aita, Yasunori Murakami, Koji Fujimura, Masataka Okabe, Norihiro Okada and

Mikiko Tanaka(2010). Allometric growth of the trunk leads to the rostral shift of the pelvic fin in teleost fishes. Dev. Biol.. 347, 236-245. (*These authors contributed equally to this work) [PubMed]

  1. Nobuhiro Kokubo, Manami Matsuura, Koh Onimaru, Tiecke Eva, Shigehiro Kuraku, Shigeru Kuratani, Mikiko Tanaka (2010). Mechanisms of heart development in the Japanese lamprey, Lethenteron

japonicum. Evol. Dev. 12, 34-44. [PubMed]

  1. Koji Sakamoto*, Koh Onimaru*, Keijiro Munakata*, Natsuno Suda, Mika Tamura, Haruki Ochi and Mikiko Tanaka (2009). Heterochronic shift in Hox-mediated activation of Sonic hedgehog

leads to morphological changes during vertebrate fin evolution. PLoS ONE, 4, e5121. (*These authors contributed equally to this work) [PubMed]

  1. Masahiro Esaki, Kazuyuki Hoshijima, Nobuhiro Nakamura, Keijiro Munakata, Mikiko Tanaka, Kayoko Ookata, Kazuhide Asakawa, Koichi Kawakami, Weiyi Wang, Eric S Weinberg, Shigehisa Hirose (2009). Mechanism of development of ionocytes rich in vacuolar-type H+-ATPase in the skin of zebrafish larvae. Dev. Biol. 329, 116-129

[PubMed]

  1. Mikiko Tanaka (2009). Evolution of vertebrate limb development(DOI: 10.1002/9780470015902.a0002099).

Encylopedia of Life Sciences.

  1. Manami Matsuura, Hidenori Nishihara, Koh Onimaru, Nobuhiro Kokubo, Shigehiro Kuraku, Rie Kusakabe, Norihiro Okada, Shigeru Kuratani and

Mikiko Tanaka (2008). Identification of four Engrailed genes in the Japanese river lamprey, Lethenteron japonicum. Dev.Dyn. 237, 1581-1589 [PubMed]

  1. Takeshi Sasaki, Hidenori Nishihara, Mika Hirakawa, Koji Fujimura, Mikiko Tanaka, Nobuhiro Kokubo, Chiharu Kimura-Yoshida, Isao Matsuo, Kenta Sumiyama, Naruya Saitou, Tomomi

Shimogori and Norihiro Okada (2008). Possible involvement of SINEs in mammalian-specific brain formation. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 105, 4220-4225. [PubMEd]

  1. Zerina Johanson, Mikiko Tanaka, Natalie Chaplin and Moya M. Smith (2008). Early Palaeozoic dentine and

patterned scales in the embryonic cat shark tail. Biol. Lett.. 4, 87-90. This paper is evaluated as one of ‘Hidden jewels” paper by Faculty of 1000. [PubMed]

  1. Eva Tiecke*, Manami Matsuura*, Nobuhiro Kokubo, Shigehiro Kuraku, Rie Kusakabe, Shigeru Kuratani and Mikiko Tanaka (2007) Identification and developmental expression of two Tbx1/10-related genes in the agnathan Lethenteron japonicum. Dev. Genes and Evol. 217, 691-697. (*These authors contributed equally to this work)

[PubMed]

  1. Megan G Davey, I Robert Paton, David R Morrice, Yili Yin, Maike Schmidt,

Paul Buxton, Despina Stamataki, Mikiko Tanaka, Andrea E Munsterberg, James Briscoe, Cheryll Tickle and Dave W Burt (2006). The Chicken talpid3 gene encodes a novel protein essential for hedgehog signaling. Genes & Dev. 20, 1365-1377. This paper is evaluated as one of ‘Exceptional” paper by Faculty of 1000. [PubMed]

  1. Mikiko Tanaka, Laura A Hale, Angel Amores, Yi-Lin Yan, William A Cresko,Tohru Suzuki

and John H Postlethwait (2005). Developmental genetic basis for the evolution of pelvic fin loss in the pufferfish Takifugu rubripes. Dev. Biol. 281, 227-239 [PubMed]

  1. Mikiko Tanaka and Cheryll Tickle (2004). Tbx18 and boundary formation in chick somite and wing development. Dev. Biol. 268, 470-480.

[PubMed]

  1. Nicholas Cole, Mikiko Tanaka, Alan R Prescott and Cheryll Tickle (2003). Expression of limb initiation

gene and clues to the basis of morphological diversification of three-spine sticklebacks. Curr. Biol. 13, R951-R952. [PubMed]

  1. Mikiko Tanaka, Andrea Munsterberg, W Gary Anderson, Alan R Prescott, Neil Hazon and Cheryll Tickle (2002). Fin development in a cartilaginous fish and the origin of vertebrate limbs. Nature 416, 527-531. This paper is evaluated as one of ‘Must read” paper by Faculty of 1000.

[PubMed]

  1. Eiji Akiba, Sayuri Yonei-Tamura, Hiroshi Yajima, Minoru Omi, Mikiko Tanaka, Mika Sato-Maeda, Koji Tamura and Hiroyuki Ide (2001). Fibroblast growth

factor-induced gene expression and cartilage pattern formation in chick limb bud recombinants. Develop. Growth & Differ. 43, 165-175. [PubMed]

  1. Maike Schmidt, Mikiko Tanaka and Andrea Munsterberg (2000). Expression of (beta)-catenin in the developing chick myotome is regulated by myogenic signals. Development 127, 4105-4113.

[PubMed]

  1. Mikiko Tanaka, Martin J Cohn, Peter Ashby, Megan Davey, Paul Martin and Cheryll Tickle (2000). Distribution of polarizing activity and potential for limb formation in mouse and chick embryos and possible relationship to polydactyly. Development 127, 4011-4021.

[PubMed]

  1. Mikiko Tanaka, Yasuyo Shigetani, Sayaka Sugiyama, Koji Tamura, Harukazu Nakamura, and

Hiroyuki Ide (1998). Apical ectodermal ridge induction by the transplantation of En-1- overexpressing ectoderm in chick limb bud. Develop. Growth & Differ. 40, 423-429. [PubMed]

  1. Masakazu Yamamoto, Yoshihiro Gotoh, Koji Tamura, Mikiko Tanaka, Atsushi Kawakami, Hiroyuki Ide and Atsushi Kuroiwa (1998). Coordinated

expression of Hoxa-11 and Hoxa-13 during limb muscle patterning. Development 125, 1325-1335 [PubMed]

  1. Mikiko Tanaka, Koji Tamura, Sumihare Noji, Tsutomu Nohno, and Hiroyuki Ide (1997). Induction of additional limb at the dorsal-ventral boundary of a chick embryo. Dev. Biol. 182, 191-203

[PubMed]

  1. Mikiko Tanaka, Koji Tamura, and Hiroyuki Ide (1996). Citral, an inhibitor of retinoic

acid synthesis, modifies chick limb development. Dev. Biol. 175, 239-247 [PubMed]

著書

  1. 田中幹子、小野沙桃実(2021)酸素が形をつくる仕組み〜酸素による「指間細胞死」誕生のシナリオ、[特集]進化の制約と方向性―微生物から多細胞生物までを貫く表現型進化原理の解明「生物の科学 遺伝」エヌ•ティー•エス、Vol. 76, No.1, pp38-43.

  2. 田中幹子(2020)2-5-12 脊椎動物の上陸、2-5 動物の進化の歴史、第2章 動物の進化「動物の事典」、朝倉書店

  3. 田中幹子(2020)水面の壁を越える〜大気中の酸素が形をつくるしくみ〜、比較内分泌学、Vol.46 No.170, pp89-91.

  4. 田中幹子(2018) 鰭形成に関る遺伝子、第9章 遺伝、「魚類学の百科事典」日本魚類学会編、丸善出版

  5. 田中幹子 (2018) 肢芽の形のできかた、第6章 動物の発生、「動物学の百科事典」(第6章「動物の発生」高宗和史、田中幹子 編)日本動物学会編、丸善出版

  6. 田中幹子(2013)レーザー技術を応用した発生学研究の新展開、第79回レーザー加工学会論文集、一般社団法人レーザー加工学会、pp31-35

  7. 田中幹子(2013)四肢の起源、形態進化のロジックを辿る-エボデボ研究最前線[動物篇]、「生物の科学 遺伝」67, 170-177.

  8. 田中幹子、鬼丸洸(2012):脊椎動物が体壁に対鰭を獲得するまでの長い道のり、「特集:複合適応形質進化の遺伝子基盤」、生物科学 63, 166-174.

Mikiko Tanaka and Cheryll Tickle (2006): Fins/limbs in the study of development. In Fins to Limbs. Brian Hall, ed. University of Chicago Press, Chicago.pp65-78

  1. 田中幹子 (2006): 手足を獲得するまでの体の設計図、「女性研究者が探る いのちの不思議」

日刊工業新聞 3 月 22 日掲載

  1. 村田有美枝、田中幹子 (2006): 脊椎動物の手足獲得に至るボディプラン

バイオサイエンスとインダストリー 64, 21-24.

  1. Mikiko Tanaka (2003): Origin of vertebrate limbs. In Development of vertebrate limbs (in Japanese). Hiroyuki Ide, ed. ICP, Tokyo. pp. 1-19.

  2. Mikiko Tanaka (2003): Dorsoventral patterning of vertebrate limbs. In Development of vertebrate limbs (in Japanese). Hiroyuki Ide, ed. ICP, Tokyo. pp. 119-132.

受賞

  • 2021年 第41回猿橋賞 田中幹子
  • 2010年 日本進化学会奨励賞 田中幹子
  • 2006年 文部科学大臣表彰 若手科学者賞 田中幹子
  • 2006年 財団法人手島工業教育資金団 中村研究賞 田中幹子
  • 2005年 日本動物学会奨励賞 田中幹子
  • 2004年 東京工業大学挑戦的研究賞 田中幹子
  • 1999年 井上研究奨励賞 田中幹子

科研費・助成金

  1. 2020年度−2023年度 科学研究費補助金 基盤研究(B)研究代表「エミューの前肢を積極的に退縮させる発生基盤の解明」
  2. 2020年度~2021年度 科学研究費補助金 新学術領域研究 研究代表「酸素で生じた「ゆらぎ」が「パターン形成プログラム」へと進化した分子基盤の解明」
  3. 2019年度~2020年度 公益財団法人アステラス病態代謝研究会 研究代表

「外的ストレスが創出する新奇形質」

  1. 2018年度~2019年度 科学研究費補助金 新学術領域研究 研究代表

「脊椎動物の陸上進出による新奇形質の誕生—環境変化により揺らぐ形態形成経路に迫る−」

  1. 2018年度~2019年度 国立研究開発法人理化学研究所共同研究 研究代表

「脊椎動物における対鰭筋の進化の分子機構」

  1. 2017年度~2019年度 科学研究費補助金 特設分野研究 基盤研究(C)研究代表

「形態パターンのゆらぎを生み出すシステムへの構成的アプローチ」

  1. 2017年度~2018年度 公益財団法人 三菱財団 平成29年度自然科学助成金 研究代表

「形態パターンに“ゆらぎ”を与える要因に迫る進化発生学的アプローチ」

  1. 2016年度−2019年度 科学研究費補助金 基盤研究(B)研究代表

「脊椎動物の上陸に伴う四肢での細胞死システムの確立」

  1. 2017年度~2018年度 公益財団法人 山田科学振興財団 研究援助 研究代表

「形態パターンのゆらぎを生み出すエピジェネティックな変化」

  1. 2018年度 国立遺伝学研究所 研究会 代表者

「マクロ生態学と遺伝学の融合」

  1. 2017年度 公益財団法人 藤原ナチュラルヒストリー振興財団 学術研究助成 研究代表

「脊椎動物の陸上進出による環境ストレスがもたらした新たな発生システムの獲得機構」

  1. 2016年 公益財団法人 ブレインサイエンス振興財団 海外研究者招聘助成  申請者

招聘研究者 Professor Anthony Graham(イギリス)

  1. 2013年度~2016年度 科学研究費補助金 基盤研究(B)研究代表

「鰭から四肢へ−陸棲適応へ向けた形態進化−」(前年度申請に伴い2015年度で終了。)

  1. 2013年度~2015年度 科学研究費補助金・基盤研究(B)研究分担

「光に依存した遺伝子発現調節システムの開発と利用」(研究代表 増田真二)

  1. 2012年度~2013年度 科学研究費補助金 新学術領域研究(公募班) 研究代表

「脊椎動物の付属肢形態を多様化させたゲノム遺伝子相関」

  1. 2012年度~2014年度 科学研究費補助金 挑戦的萌芽研究 研究代表

「高出力フェムト秒レーザーによる哺乳類胚の単一細胞の遺伝子

  1. 2012年度 公益財団法人 武田科学振興財団 ライフサイエンス研究奨励 研究代表「四肢形態パターンを緻密に制御する細胞死調節機構の解明」
  2. 2010年度~2011年度 科学研究費補助金 挑戦的萌芽研究 研究代表

「フェムト秒レーザーによる動物胚の単一細胞へのバイオナノ粒子物理的導入方法の開発」 

  1. 2009年度 財団法人 内藤記念科学振興財団 内藤記念科学奨励金研究助成 研究代表

「転写因子の二つの活性モードによる四肢−脇腹境界の設定機構」

  1. 2008年度 財団法人 稲盛財団 研究助成金 研究代表「四肢形態進化の分子基盤へのアプローチ」
  2. 2006年度 財団法人 中島記念国際交流財団若手研究者研究助成金 研究代表

「硬骨魚類をモデルにした形態多様化メカニズムへのアプローチ」

  1. 2006年度~2008年度 財団法人 東レ科学振興会科学技術研究助成金 研究代表 

「脊椎動物の多様化戦略への分子的アプローチ」

  1. 2005年度 公益信託 成茂動物科学振興基金 研究代表

「硬骨魚類の多様化戦略−変化する腹鰭の位置設定機構」

  1. 2005年度 公益信託 林女性自然科学者研究助成基金 研究代表

「脊椎動物に四肢を獲得させたボディプラン戦略の解明」

  1. 2005年度~2007年度 科学研究費補助金 若手研究A 研究代表

「脊椎動物の首から尾に広がる肢形成能獲得の歴史の探究—四肢の起源に迫るー

  1. 2004年度 財団法人 上原記念生命科学財団研究奨励金 研究代表

「肢形成不全機構のフグを用いた解析」

  1. 2004年度 財団法人 伊藤科学振興会研究助成金 研究代表

「四肢・対鰭形成を制御する脊椎動物のボディープランの解明」

  1. 2003年度 財団法人 上原記念生命科学財団 海外留学助成金PDフェローシップ

「肢形成不全機構のフグを用いた解析」

  1. 2001年4月~2002年9月 日本学術振興会 特別研究員PD

「脊椎動物のボディプランにおける背腹決定機構の研究」

  1. 1999年度~2000年度 日本学術振興会 海外特別研究員

「ニワトリ初期胚肢芽におけるAER 形成機構の研究」

  1. 1998年度 日本学術振興会 特別研究員DC2

「ニワトリ胚予定肢芽域の背腹境界面にAER が形成される機構の解析」